Гъбите дълго време са били класифицирани като растения, преди учените да ги отделят в самостоятелно царство. Известно е, че преди милиард години гъбите и медузите са имали общ прародител, след което еволюционните им пътища се разделят. Животните, включително медузите, притежават гъвкави клетъчни стени, смилат храната вътре в тялото, имат нерви и мускули, и са способни на движение. За разлика от тях, гъбите имат твърди клетъчни стени, смилат храната извън тялото, не се движат и нямат нерви и мускули.
Медузите, които принадлежат към вида жилещи, са се появили на планетата преди поне 500 милиона години, когато гъбите вече са били обособени в отделно царство. Повечето съвременни животински групи са възникнали преди приблизително 540-520 милиона години по време на камбрийската експлозия. Най-ранните морски гъби датират от едиакарската епоха, предхождаща камбрия.
Международен екип от генетици от Калифорнийския университет в Бъркли (UC Berkeley) представи доказателства, че първите многоклетъчни животни са били по-близки до гребеновидните медузи, отколкото до гъбите. Професор Даниел Рохсар от UC Berkeley посочва, че хромозомният анализ опровергава традиционното схващане, че гъбите са потомци на най-древните животни. Според изследователите, първите медузи и предците на съвременните гребеновидни медузи са се появили малко след вкаменените останки на най-ранните морски гъби.
